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Biblioteca(s):  Embrapa Pecuária Sudeste.
Data corrente:  01/09/2017
Data da última atualização:  21/05/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  VIGNATO, B. S.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; BALIEIRO, J. C. de C.
Afiliação:  Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Júlio Cesar de Carvalho Balieiro, FZEA/USP.
Título:  Comparative muscle transcriptome associated with carcass traits of Nellore cattle.
Ano de publicação:  2017
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v. 18, n. 506, p. 1-13, 2017.
ISSN:  1471-2164
DOI:  https://doi.org/10.1186/s12864-017-3897-x
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Commercial cuts yield is an important trait for beef production, which affects the final value of the products, but its direct determination is a challenging procedure to be implemented in practice. The measurement of ribeye area (REA) and backfat thickness (BFT) can be used as indirect measures of meat yield. REA and BFT are important traits studied in beef cattle due to their strong implication in technological (carcass yield) and nutritional characteristics of meat products, like the degree of muscularity and total body fat. Thus, the aim of this work was to study the Longissimus dorsi muscle transcriptome of Nellore cattle, associated with REA and BFT, to find differentially expressed (DE) genes, metabolic pathways, and biological processes that may regulate these traits.
Palavras-Chave:  Backfat thickness; Bos taurus indicus; Ribeye area.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/163306/1/s12864-017-3897-x.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CPPSE24092 - 1UPCAP - DDPROCI-2017.00032VIG2017.00160
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1.Imagem marcado/desmarcadoVIGNATO, B. S.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; BALIEIRO, J. C. de C. Comparative muscle transcriptome associated with carcass traits of Nellore cattle. BMC Genomics, v. 18, n. 506, p. 1-13, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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2.Imagem marcado/desmarcadoVIGNATO, B. S.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; BALIEIRO, J. C. de C. NEDD4: a putative candidate gene for ribeye area in Nellore steers. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 15. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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3.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, G. B.; KAPPELER, B. G.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Micrornas expression profile and functional enrichment of Longissimus Dorsi muscle in Nellore cattle. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Anais...Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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4.Imagem marcado/desmarcadoKAPPELER, B. I. G.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; MOREIRA, G. C. M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L. MiRNAs differentially expressed in skeletal muscle of animals with divergent estimated breeding values for beef tenderness. Molecular Biology, v. 20, n. 1, p. 2-11, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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5.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, G. B. de; CESAR, A. S. M.; FELÍCIO, A. M.; KAPPELER, B. I. G.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Evidence of miRNA regulation of intramuscular fat deposition in beef cattle. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego. Anais... San Diego: PAG, 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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6.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, G. C. M.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D. J.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association studies reveal genomic windows and candidate genes related to fat deposition in chickens. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Pôster P0647.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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7.Imagem marcado/desmarcadoVIGNATO, B. S.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; BALIEIRO, J. C. de C. Gene co-expression network analysis associated with carcass traits in Nellore steers. In: ANNUAL CONFERENCE OF AUSTRALIAN MARINE SCIENCES ASSOCIATION, 57., 2017, Darwin, Australia. Proceedings... Darwin, Australia: AMSA, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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8.Imagem marcado/desmarcadoVIGNATO B. S.; COUTINHO, L. L.; POLETI, M. D.; CESAR, A. S. M.; MONCAU, C. T.; REGITANO, L. C. de A.; BALIEIRO, J. C. C. Gene co-expression networks associated with carcass traits reveal new pathways for muscle and fat deposition in Nelore cattle. Genomics, v. 20, n. 32, p. 2-13, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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9.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, G. B. de; CESAR, A. S. M.; FELICIO, A. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Gene network regulated by microRNAs suggests modulation of fat deposition in cattle. Journal of Animal Science, v. 94, e-suppl. 5; Journal of Dairy Science, v. 99, e-suppl. 1, p. 159, jul. 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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10.Imagem marcado/desmarcadoDINIZ, W. J. DA S.; TIZIOTO, P. C.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A. Transcriptomic analysis identifies differentially expressed genes related to lipid metabolism in extreme animals for GEBV for iron content in the muscle Nelore steers. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 52., Belo Horizonte, 2015. Anais... Belo Horizonte: SBZ, 2015.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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11.Imagem marcado/desmarcadoRIPAMONTE, P.; BACCAGLINI, M.; CESAR, A. S. M.; FIGUEIREDO, L. G. G.; BALIEIRO, J. C. C.; CAETANO, A. R.; MEIRELLES, F. V. Estimation of taurindicine hybridization of American Zebu cattle in Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 1, p. 393-403, 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoCOUTINHO, L. L.; MOROSINI, N. S.; CESAR, A. S. M.; POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; MARGARIDO, G. R. A. Identification and characterization of euchromatic regions associated with gene expression and intramuscular fat in Nelore cattle. Journal of Animal Science, v. 96, suppl. S3, p. 233-234, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSILVEIRA, J. C. da; FERRONATO, G. de A.; OLIVEIRA, J. F. C. de; HENKES, L. E.; BENAVIDES, M. V.; CESAR, A. S. M. Marcadores moleculares aplicados à seleção animal. In: GONÇALVES, P. B. D.; FIGUEIREDO, J. R. de; GASPERIN, B. G. (ed.). Biotécnicas aplicadas à reprodução animal e à humana. 3. ed. Rio de Janeiro: Roca, 2021. p. 323-340.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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14.Imagem marcado/desmarcadoGEISTLINGER, L.; SILVA, V. H. da; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. C.; WALDRON, L.; ZIMMER, R.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. Widespread modulation of gene expression by copy number variation in skeletal muscle. Scientific Reports, v. 8, n. 1399, p. 1-11, jan. 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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15.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. M.; MOKRY, F. C.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A.; CESAR, A. S. M.; MORÉ, D.; MOURÃO, G.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; ZERLOTINI, A.; REGITANO, L. C. Allele specific expression analysis in bovine muscle tissue. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF TH AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... São Paulo: USP-São Paulo, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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16.Imagem marcado/desmarcadoPOLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUZA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; VIGNATTO, B. S.; MONTENEGRO, H.; PÉRTILLE, F.; BALIEIRO, J. C. C.; CAMERON, L. C.; ELER, J. P.; COUTINHO, L. L. Proteome alterations associated with the oleic acid and cis-9, trans-11 conjugated linoleic acid content in bovine skeletal muscle. Journal of Proteomics, v. 222, p. 1-14, e103792, jun. 2020.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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17.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A. Complex pattern of CAST allelic expression in bovine muscle tissue. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 22., 2014, Boston, USA. Program... [Boston]: International Society for Computational Biology, 2014. Não paginado. ISMB 2014. Pôster E13.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoNOVAIS, F. J. DE; YU, H.; CESAR, A. S. M.; MOMEN, M.; POLETI, M. D.; PETRY, B.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.; MOROTA, G.; COUTINHO, L. L. Multi-omic data integration for the study of production, carcass, and meat quality traits in Nellore cattle. Frontiers in Genetics, v. 13, 948240, oct. 2022. 14 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, M. M.; ZERLOTINI, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. A. Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10.; 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: American Society of Animal Science, 2014. Não paginado. WCGALP 2014.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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20.Imagem marcado/desmarcadoDEFANT, H.; MEIRA, A. N.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; MOREIRA, G. C. M.; PADUAN, M.; MARIANI, P.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; CESAR, A. S. M. Novel polymorphisms in the PLIN2 gene of Nellore cattle. Genetics and Molecular Research, v. 18, n. 3, 2019. Não paginado. Na publicação: Luciana CA Regitano, Adhemar Zerlotini. gmr16039963.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.
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